Entwicklung einer netzfreien Galerkinmethode für Zellmechanik mit großen Deformationen

1 Finite Elemente Diskretisierung eines roten Blutkörperchens und eines Blutplättchens [1]

In der Biomechanik werden mechanische Modelle von Zellen, zum Beispiel roten Blutkörperchen verwendet, welche selbst bei wenig komplexen Geometrien mit einer hohen Anzahl finiter Elemente diskretisiert werden müssen (Abbildung 1). Der daraus folgende hohe Rechenaufwand erschwert den Einsatz dieser Modelle für großskalige Simulationen mit vielen Zellen.

Netzfreie Methoden, welche die Geometrie der Zelle mit deutlich weniger nichtlokalen Ansatzfunktionen parametrisieren, können die Anzahl der Freiheitsgrade deutlich reduzieren. Die sogenannten Kugelflächenfunktionen bilden eine Orthonormalbasis von Funktionen auf der Kugeloberfläche, mit denen sich die Oberfläche von im weitesten Sinne kugelartige Gebieten (sog. Sterngebiete) beliebig gut annähern lassen. Oft reichen für eine gute Approximation schon relativ wenige Kugelflächenfunktionen aus (Abbildung 2).

 

2 Approximation einer hochdimensional triangulierten Geometrie (links) mit 36 Kugelflächenfunktionen
(rechts) [2]

In der vorliegenden Masterarbeit soll basierend auf den Kugelflächenfunktionen und ihren Gradienten (den Vektorkugelflächenfunktionen) als netzfreie Ansatzfunktionen eine Galerkinmethode bei großen Deformationen hergeleitet werden. Dabei wird ein Membranmodell der Zelle verwendet, worin die Zellmembran keine Biegesteifigkeit aufweist. Es soll zunächst die Kinematik in Kugelkoordinaten aufgestellt und mit einem geeignetes Konstitutivgesetz für eine Zellmembran kombiniert werden. Anschließend wird das Modell linearisiert und mithilfe der Ansatzfunktionen diskretisiert. Wenn möglich sollte eine Implementierung zum Beispiel in Mathematica oder MATLAB für einfache Randbedingungen erstellt werden.

Literatur:
[1] G. Závodszky, B. van Rooij, V. Azizi , A. Hoekstra. Cellular Level In-silico Modeling of Blood Rheology with an Improved Material Model for Red Blood Cells, Frontiers in Physiology 8, 2017
[2] C. Ducroz, J.-C. Olivo-Marin, A. Dufour. Characterization of Cell Shape and Deformation in 3D using Spherical Harmonics. 9th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Barcelona, Spain, 2012, pp. 848-851.

Ansprechpartner:
Prof. Dr.-Ing. Thomas Hochrainer
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